|
MBGL7112 | Filogenetik Sistematik | 3+0+0 | AKTS:7.5 | Yıl / Yarıyıl | Bahar Dönemi | Ders Duzeyi | Doktora | Yazılım Şekli | Seçmeli | Bölümü | MOLEKÜLER BİYOLOJİ ve GENETİK ANABİLİM DALI | Ön Koşul | Yok | Eğitim Sistemi | | Dersin Süresi | 14 hafta - haftada 3 saat teorik | Öğretim Üyesi | Prof. Dr. Yusuf BEKTAŞ | Diğer Öğretim Üyesi | | Öğretim Dili | Türkçe | Staj | Yok | | Dersin Amacı: | |
Öğrenim Kazanımları | PÖKK | ÖY | Bu dersi başarı ile tamamlayan öğrenciler : | | | ÖK - 1 : | Filogenetik sistematiğindeki temel kavramları anlar. | 2,3 | 1,2,3, | ÖK - 2 : | Moleküler verilerden elde edilen filogenetik ağaçlarla ilgili problemleri, varsayımları ve metotları bilir. | 2,3 | 1,2,3, | ÖK - 3 : | Filogenetik sistematikte kullanılan moleküler belirteçleri bilir ve kullanır. | 2,10 | 1,2,3, | ÖK - 4 : | Güncel filogenetik araştırmaları anlayıp tartışabilir. | 3,10 | 1,2,3, | PÖKK :Program öğrenim kazanımlarına katkı, ÖY : Ölçme ve değerlendirme yöntemi (1: Yazılı Sınav, 2: Sözlü Sınav, 3: Ev Ödevi, 4: Laboratuvar Çalışması/Sınavı, 5: Seminer / Sunum, 6: Dönem Ödevi / Proje),ÖK : Öğrenim Kazanımı | |
Haftalık Detaylı Ders Planı | Hafta | Detaylı İçerik | Önerilen Kaynak | Hafta 1 | Temel sistematik kavramlar | | Hafta 2 | Filogenetik sistematiğin konusu | | Hafta 3 | Tür kavramları, türleşme, ağaçların okunması | | Hafta 4 | Filogenetik çıkarsama ve ağaç inşaası | | Hafta 5 | Filogenetiğin tarihi, özelliklerin evrimi | | Hafta 6 | Moleküler evrim, işaretleyici genler, filogenomik: mitokondriyal genler | | Hafta 7 | Moleküler evrim, işaretleyici genler, filogenomik: nükleer genler | | Hafta 8 | Ara Sınav | | Hafta 9 | Moleküler filogenetik, genetik mesafe | | Hafta 10 | Genetik mesafe, ikame modelleri, moleküler saatler | | Hafta 11 | Dizi evrimi modelleri, ataların durumunun yeniden inşası | | Hafta 12 | Dizi evrimi modelleri, ataların durumunun yeniden inşası: Maksimum olasılık | | Hafta 13 | Dizi evrimi modelleri, ataların durumunun yeniden inşası: Bayesci yaklaşım | | Hafta 14 | Çeşitlenme, evrim oranları | | Hafta 15 | Filogenetik sistematiğin uygulamaları | | Hafta 16 | Dönem sonu sınavı | | |
1 | Wägele, J.W. 2005; Foundations of Phylogenetic Systematics, Friedrich Pfeil, | | 2 | Rippel, O. 2016; Phylogenetic Systematics Haeckel to Hennig, CRC Press, 402p. | | |
Ölçme Yöntemi | Yöntem | Hafta | Tarih | Süre (Saat) | Katkı (%) | Arasınav | 8 | | 1 | 30 | Ödev | 7 14 | | 14 | 20 | Dönem sonu sınavı | 16 | | 2 | 50 | |
Öğrenci Çalışma Yükü | İşlem adı | Haftalık süre (saat) | Hafta sayısı | Dönem toplamı | Yüz yüze eğitim | 2 | 14 | 28 | Sınıf dışı çalışma | 20 | 1 | 20 | Arasınav için hazırlık | 30 | 1 | 30 | Arasınav | 2 | 1 | 2 | Ödev | 40 | 2 | 80 | Dönem sonu sınavı için hazırlık | 30 | 1 | 30 | Dönem sonu sınavı | 2 | 1 | 2 | Toplam Çalışma Yükü | | | 192 |
|