|
|
| MBGL7040 | Prokaryot Sistematiğinde Polifazik Yöntemlerin Kullanımı | 3+0+0 | AKTS:7.5 | | Yıl / Yarıyıl | Bahar Dönemi | | Ders Duzeyi | Doktora | | Yazılım Şekli | Seçmeli | | Bölümü | MOLEKÜLER BİYOLOJİ ve GENETİK ANABİLİM DALI | | Ön Koşul | Yok | | Eğitim Sistemi | Yüz yüze | | Dersin Süresi | 14 hafta - haftada 3 saat teorik | | Öğretim Üyesi | Prof. Dr. Kadriye İNAN BEKTAŞ | | Diğer Öğretim Üyesi | | | Öğretim Dili | Türkçe | | Staj | Yok | | | | Dersin Amacı: | | Bakteri sistematiğinde kullanılan güncel polifazik analizleri, geleneksel analizlerle karşılaştırmalı olarak incelemek, bakteri sistematiğinin esaslarını anlamak, polifazik yöntemleri uygulayabilmek ve elde edilen verileri analiz ederek bir izolatı geçerli taksonlara yerleştirebilmenin esaslarını öğrenmek. |
| Öğrenim Kazanımları | PÖKK | ÖY | | Bu dersi başarı ile tamamlayan öğrenciler : | | | | ÖK - 1 : | Polifazik yöntemleri bilir | 3 | 1,5, | | ÖK - 2 : | Polifazik yöntemleri seçebilir ve uygulayabilir | 3 | 1,5, | | ÖK - 3 : | Bakteri sistematiğinde güncel kriterleri bilir | 3 | 1,5, | | ÖK - 4 : | Verileri analiz edip bakteri sistematiğinde değerlendirebilir | 3 | 1,5, | | PÖKK :Program öğrenim kazanımlarına katkı, ÖY : Ölçme ve değerlendirme yöntemi (1: Yazılı Sınav, 2: Sözlü Sınav, 3: Ev Ödevi, 4: Laboratuvar Çalışması/Sınavı, 5: Seminer / Sunum, 6: Dönem Ödevi / Proje),ÖK : Öğrenim Kazanımı | | |
| Dersin içeriği; polifazik taksonomi tanımı ve bakteri sistematiğindeki yeri, Geleneksel sınıflandırmanın yetersizliği,Yağ asitlerinin ekstraksiyonu, Mikolik asit ekstraksiyonu ve TLC analizleri, Menaquinon izolasyonu ve TLC saflaştırması, Şeker ekstraksiyonu ve TLC analizleri, Ubukinon izolasyonu ve TLC saflaştırması, Lipid ekstraksiyonu ve TLC analizleri, Murein tabakasının kimyasal kompozisyonu ve taksonomik marker olarak kullanımı, Mikrobiyal Taksonomiye uygulanan DNA-DNA hibridizasyon Yöntemleri,Houskiping genler ve önemi, Bakteriyal Genotiplendirme için DNA mikroarrayleri, Bakteriyal sistematikte pirolizis kütle spektrometrisi, Nükleik Asit dizilerinden filogenetik ağaç çizimi.
|
| |
| Haftalık Detaylı Ders Planı | | Hafta | Detaylı İçerik | Önerilen Kaynak | | Hafta 1 | Polifazik taksonomi tanımı ve bakteri sistematiğindeki yeri. | | | Hafta 2 | Geleneksel sınıflandırmanın yetersizliği | | | Hafta 3 | Yağ asitlerinin ekstraksiyonu | | | Hafta 4 | Mikolik asit ekstraksiyonu ve TLC analizleri | | | Hafta 5 | Mikolik asit ekstraksiyonu ve TLC analizleri | | | Hafta 6 | Şeker ekstraksiyonu ve TLC analizleri | | | Hafta 7 | Ubukinon izolasyonu ve TLC saflaştırması | | | Hafta 8 | Lipid ekstraksiyonu ve TLC analizleri | | | Hafta 9 | Sınav | | | Hafta 10 | Murein tabakasının kimyasal kompozisyonu ve taksonomik marker olarak kullanılması | | | Hafta 11 | Mikrobiyal Taksonomiye uygulanan DNA-DNA hibridizasyon Yöntemleri | | | Hafta 12 | Houskiping genler ve önemi | | | Hafta 13 | Nükleik Asit dizilerinden filogenetik ağaç cizimi | | | Hafta 14 | Bakteriyal Genotiplendirme için DNA mikroarrayleri | | | Hafta 15 | Bakteriyal sistematikte pirolizis kütle spektrometrisi | | | Hafta 16 | Sınav | | | |
| 1 | Handbook of New Bacterial Systematics. Edt: M. Goodfellow and A.G. O'Donnell, Academic Press, London, 1993. Applied Microbial Systematics, Priest F G. and Goodfellow, Kluwer Academic Publishers, 2000. | | | 2 | Nucleic acid techniques in bacterial systematics; Erko Stackebrandt and Michael Goodfellow. | | | |
| 1 | Modern Bacterial Taxonomy, F. G. Priest, B. Austin | | | 2 | Molecular Identification, Systematics, and Population Structure of Prokaryotes; Stackebrandt, Erko | | | |
| Ölçme Yöntemi | | Yöntem | Hafta | Tarih | Süre (Saat) | Katkı (%) | | Arasınav | 9 | | 2 | 30 | | Sunum | 13
14
15 | | | 20 | | Dönem sonu sınavı | 16 | | | 50 | | |
| Öğrenci Çalışma Yükü | | İşlem adı | Haftalık süre (saat) | Hafta sayısı | Dönem toplamı | | Yüz yüze eğitim | 3 | 14 | 42 | | Sınıf dışı çalışma | 4 | 10 | 40 | | Arasınav için hazırlık | 4 | 8 | 32 | | Arasınav | 2 | 1 | 2 | | Dönem sonu sınavı için hazırlık | 4 | 14 | 56 | | Dönem sonu sınavı | 2 | 1 | 2 | | Diğer 1 | 4 | 10 | 40 | | Toplam Çalışma Yükü | | | 214 |
|