|
|
| BIY4032 | Biyoinformatik | 3+0+0 | AKTS:5 | | Yıl / Yarıyıl | Bahar Dönemi | | Ders Duzeyi | Lisans | | Yazılım Şekli | Seçmeli | | Bölümü | BİYOLOJİ BÖLÜMÜ | | Ön Koşul | Yok | | Eğitim Sistemi | Yüz yüze , Grup çalışması, Uygulama | | Dersin Süresi | 14 hafta - haftada 3 saat teorik | | Öğretim Üyesi | Prof. Dr. Ali Osman BELDÜZ | | Diğer Öğretim Üyesi | Doç.Dr.Sabriye ÇANAKÇI | | Öğretim Dili | Türkçe | | Staj | Yok | | | | Dersin Amacı: | | Dersin belirtilen içeriğinin güncel yöntemler ve bilgiler kullanılarak öğrenciye en iyi şekilde aktarılması |
| Öğrenim Kazanımları | BPKK | ÖY | | Bu dersi başarı ile tamamlayan öğrenciler : | | | | ÖK - 1 : | DNA dizini bilgilerinin nasıl elde edildiğini, toplandığını, düzenlendiğini, yönetildiğini ve gruplandığını anlamalı | 4,9 | 1,3,4,5 | | ÖK - 2 : | biyolojik bilgilere ulaşabilmek için,standart biyoinformatik araçları kullanabilmeli | 4,9 | 1,3,4,5 | | ÖK - 3 : | biyoinformatik programlarında kullanılan algoritmaların teorik temellerini bilmeli | 4,9 | 1,3,4,5 | | BPKK :Bölüm program kazanımlarına katkı, ÖY : Ölçme ve değerlendirme yöntemi (1: Yazılı Sınav, 2: Sözlü Sınav, 3: Ev Ödevi, 4: Laboratuvar Çalışması/Sınavı, 5: Seminer / Sunum, 6: Dönem Ödevi / Proje),ÖK : Öğrenim Kazanımı | | |
| Moleküler biyoloji, genetik ve yakın alanlarda sıkça başvurulan veritabanlarına ulaşım, genler ve proteinlerin homolojinin karşılaştırılması, primer tasarlama, moleküler uygulamalar, restriksiyon haritası oluşturma, yapı tahmini, soy ağacı oluşturma. |
| |
| Haftalık Detaylı Ders İçeriği | | Hafta | Detaylı İçerik | Önerilen Kaynak | | Hafta 1 | Biyoinformatiğe giriş | | | Hafta 2 | Biyoinformatik ne için kullanılır | | | Hafta 3 | Baz Dizini Veritabanları | | | Hafta 4 | Protein aino asit dizini veri tabanları | | | Hafta 5 | Tek bir DNA dizini ile analizler | | | Hafta 6 | Tek bir protein amino asit dizini ile analizler | | | Hafta 7 | Dizi veritabanlarında benzerlik araştırmaları | | | Hafta 8 | İki dizinin karşılaştırılması | | | Hafta 9 | Arasınav | | | Hafta 10 | Öğrenci seminerleri | | | Hafta 11 | Öğrenci seminerleri | | | Hafta 12 | Öğrenci seminerleri | | | Hafta 13 | çoklu dizi hizalama | | | Hafta 14 | dizilerin incelenmesi ve gen bankalarına iletilmesi | | | Hafta 15 | RNA ve Proteinlerin 3D yapılarının incelenmesi ve filogenetik ağaç oluşturma | | | Hafta 16 | Dönem sonu sınavı | | | |
| 1 | Bioinformatics For Dummies, 2nd EditionBy Jean-Michel Claverie, Ph. D., Cedric Notredame, Ph.D. December 2006, 436pp, ISBN: 978-0-470-08985-9, JOHN WILEY. | | | 2 | Lecturer Notes | | | |
| 1 | Bioinformatics: A Biologist's Guide to Biocomputing and the Internet, January 2000, Hardcover, 200pp, ISBN: 188129918X, Eaton Publishing Company/Bio Techniques Boks. | | | |
| Ölçme Yöntemi | | Yöntem | Hafta | Tarih | Süre (Saat) | Katkı (%) | | Arasınav | 9 | 21/04/2022 | 60 | 40 | | Sunum | 11 | 29/04/2022 | 30 | 10 | | Dönem sonu sınavı | 16 | 16/06/2022 | 50 | 50 | | |
| Öğrenci Çalışma Yükü | | İşlem adı | Haftalık süre (saat) | Hafta sayısı | Dönem toplamı | | Yüz yüze eğitim | 3 | 14 | 42 | | Sınıf dışı çalışma | 3 | 14 | 42 | | Laboratuar çalışması | 0 | 0 | 0 | | Arasınav için hazırlık | 2 | 7 | 14 | | Arasınav | 2 | 1 | 2 | | Uygulama | 2 | 1 | 2 | | Klinik Uygulama | 0 | 0 | 0 | | Ödev | 0 | 0 | 0 | | Proje | 3 | 7 | 21 | | Kısa sınav | 0 | 0 | 0 | | Dönem sonu sınavı için hazırlık | 5 | 2 | 10 | | Dönem sonu sınavı | 0 | 0 | 0 | | Diğer 1 | 3 | 5 | 15 | | Diğer 2 | 2 | 1 | 2 | | Toplam Çalışma Yükü | | | 150 |
|